基因有問題做三代試管嬰兒生下的孩子也可能攜帶一些遺傳性疾病或基因突變。因此，做三代試管嬰兒也不能保證健康，但是可以通過篩查和測試盡可能地降低風險。在進行三代試管嬰兒前，建議夫妻雙方去醫(yī)院進行全面的遺傳咨詢和基因測試，以確保健康的孩子出生，進一步實現(xiàn)優(yōu)生優(yōu)育的目的。

第三代試管嬰兒生出來的寶寶身體不一定都是健康的，該技術雖然能避免胚胎染色體異常，畢竟三代試管可以篩查的疾病只有100多種，而世界上發(fā)現(xiàn)的遺傳性疾病高達幾千種。對于未知的遺傳疾病目前并不一定能完全避免，所以說通過第三代試管嬰兒技術出生的寶寶也可能會存在健康問題。

如果夫妻一方或者雙方有基因問題，是可以通過三代試管嬰兒來避免遺傳的。事實上，遺傳基因問題符合三代試管的適應癥指征。第三代試管嬰兒技術不同于其他兩代試管，它可以對胚胎的基因進行檢測篩查，剔除基因有問題的胚胎，移植質(zhì)量好的胚胎，從而胚胎不會遺傳父母的致病基因。