安徽中醫(yī)藥大學(xué)第二附屬醫(yī)院創(chuàng)建于1985年，是較早成立和規(guī)模較大的省級(jí)針灸專(zhuān)科醫(yī)院，2005年在率先獲得正規(guī)甲等中醫(yī)針灸專(zhuān)科醫(yī)院。是中醫(yī)藥管理局“中醫(yī)藥國(guó)際合作基地”、世界針灸學(xué)會(huì)聯(lián)合會(huì)“臨床基地”、中醫(yī)藥管理局“中醫(yī)藥標(biāo)準(zhǔn)化研究推廣基地”和針灸學(xué)會(huì)“針灸標(biāo)準(zhǔn)化研究示范基地”。醫(yī)院歷經(jīng)20多年的建設(shè)與發(fā)展，認(rèn)真貫徹落實(shí)黨和衛(wèi)生與中醫(yī)藥工作方針**，堅(jiān)持“大專(zhuān)科、小綜合”的發(fā)展模式，堅(jiān)持“以針灸特色求生存、以專(zhuān)科優(yōu)勢(shì)求發(fā)展”的辦院方向，各項(xiàng)工作取得了明顯地成效。醫(yī)院床位規(guī)模進(jìn)一步擴(kuò)大，醫(yī)療服務(wù)質(zhì)量和效益明顯提高；針灸特色優(yōu)勢(shì)進(jìn)一步發(fā)揮，特色中醫(yī)院、核心學(xué)科和核心專(zhuān)科專(zhuān)病建設(shè)得到加強(qiáng)；人才隊(duì)伍素質(zhì)進(jìn)一步提高，臨床、教學(xué)和科研水平有所提升；對(duì)外交流和社會(huì)影響進(jìn)一步擴(kuò)大，職工凝聚力和發(fā)展信心不斷增強(qiáng)。

醫(yī)院現(xiàn)有編制床位300張，通達(dá)床位800張，擁有3個(gè)臨床核心專(zhuān)科，2個(gè)中醫(yī)藥管理局核心學(xué)科，6個(gè)中醫(yī)藥管理局核心專(zhuān)科。擁有名老中醫(yī)學(xué)術(shù)經(jīng)驗(yàn)繼承導(dǎo)師4人，中醫(yī)藥臨床人才3人，首屆“江淮名醫(yī)”5人，安徽省中醫(yī)藥學(xué)科帶頭人層次8人，碩士研究生導(dǎo)師16人，設(shè)有6個(gè)臨床教研室，為針灸臨床專(zhuān)業(yè)碩士點(diǎn)，先后接收了美國(guó)、加拿大、法國(guó)、德國(guó)、澳大利亞、日本、韓國(guó)、新加坡等的留學(xué)生、進(jìn)修生及碩士研究生100多人，有40多名醫(yī)生赴美國(guó)、德國(guó)、瑞士、法國(guó)、英國(guó)、澳大利亞、新加坡、也門(mén)、伊朗等進(jìn)行學(xué)術(shù)交流，與德國(guó)、波蘭、新加坡、瑞士等國(guó)建立了聯(lián)合辦醫(yī)、辦學(xué)、學(xué)歷教育等合作項(xiàng)目，參加也門(mén)等援外醫(yī)療工作。近五年來(lái)承擔(dān)了科研課題3項(xiàng)、省部級(jí)4項(xiàng)、廳局級(jí)35項(xiàng)，獲得省科技成果獎(jiǎng)2項(xiàng)，發(fā)明專(zhuān)利11項(xiàng)。醫(yī)院現(xiàn)已逐步形成了以針灸專(zhuān)科為龍頭，以腦病科、骨傷科、老年病科、脾胃病科和康復(fù)科為主體，以一批特色專(zhuān)科專(zhuān)病建設(shè)為支撐，以開(kāi)展和應(yīng)用各類(lèi)特色針灸并結(jié)合推拿、手法、中藥、康復(fù)等為主要治療手段，以一批具有較好優(yōu)勢(shì)病種為標(biāo)志的中醫(yī)針灸臨床學(xué)科構(gòu)架和體系，取得了較大的特色專(zhuān)科規(guī)模效應(yīng)和良好的經(jīng)濟(jì)社會(huì)效益。醫(yī)院2012年門(mén)診病人、出院人次、業(yè)務(wù)收入與“十一五”期末相比分別增長(zhǎng)124%、114%、178%，門(mén)診非藥物中醫(yī)特色治療比例達(dá)到90%以上，病房及門(mén)診中醫(yī)治療率分別達(dá)到75%、92%，中醫(yī)治療和中藥費(fèi)用占業(yè)務(wù)收入比例達(dá)60%以上。

當(dāng)前，中醫(yī)藥事業(yè)的發(fā)展得到了少有的高度重視和支持，國(guó)務(wù)院《關(guān)于扶持和促進(jìn)中醫(yī)藥事業(yè)發(fā)展的若干意見(jiàn)》提出了一系列**和措施。安徽省委、省《關(guān)于深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改進(jìn)的實(shí)施意見(jiàn)》把扶持和促進(jìn)中醫(yī)藥發(fā)展列為今后3年醫(yī)改6項(xiàng)核心任務(wù)之一，明確提出要“大力推進(jìn)以針灸學(xué)術(shù)研究為核心的中醫(yī)藥國(guó)際交流與合作基地建設(shè)”。安徽省《關(guān)于進(jìn)一步加快中醫(yī)藥事業(yè)發(fā)展的意見(jiàn)》對(duì)針灸醫(yī)院的建設(shè)也提出了明確的目標(biāo)。副部長(zhǎng)、中醫(yī)藥管理局局長(zhǎng)王國(guó)強(qiáng)曾兩次視察醫(yī)院，并在針灸學(xué)會(huì)第五次會(huì)員代表大會(huì)上明確表示要支持像安徽中醫(yī)學(xué)院附屬針灸醫(yī)院一樣的針灸專(zhuān)科醫(yī)院的建設(shè)和發(fā)展。

面向“十二五”，醫(yī)院將繼續(xù)堅(jiān)持以科學(xué)發(fā)展觀為統(tǒng)領(lǐng)，堅(jiān)持以人為本和以病人為中心的服務(wù)宗旨，堅(jiān)持以針灸特色立院、以專(zhuān)科優(yōu)勢(shì)興院、以質(zhì)量效益強(qiáng)院辦院方向，堅(jiān)持實(shí)施“名院、名科、名醫(yī)”的發(fā)展戰(zhàn)略，堅(jiān)持以專(zhuān)科專(zhuān)病建設(shè)為核心、以人才隊(duì)伍建設(shè)為關(guān)鍵、以完善基礎(chǔ)功能為支撐、以擴(kuò)大對(duì)外交流為延伸、以深化改進(jìn)創(chuàng)新為動(dòng)力，以強(qiáng)化管理服務(wù)為保障的發(fā)展思路，實(shí)現(xiàn)“規(guī)模結(jié)構(gòu)合理、特色優(yōu)勢(shì)凸顯、質(zhì)量效益較高、管理服務(wù)較好，帶領(lǐng)全省、輻射、面向國(guó)際的現(xiàn)代化、專(zhuān)科性、研究型中醫(yī)針灸醫(yī)院”的建設(shè)目標(biāo)，努力把醫(yī)院建設(shè)成為具有國(guó)內(nèi)率先水平、在國(guó)際上有重要影響的針灸醫(yī)學(xué)基地，成為針灸醫(yī)療、科研和人才培養(yǎng)的中心，成為祖國(guó)傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)國(guó)際交流與合作的窗口，成為安徽省中醫(yī)藥事業(yè)的專(zhuān)業(yè)品牌。