，又名江蘇省傳染病醫(yī)院、東南大學附屬第二醫(yī)院，南京市醫(yī)院、南京市老年病醫(yī)院和該院合署。由宋美齡基金會創(chuàng)建于1933年，至今已有80年歷史。醫(yī)院專業(yè)設施完善，技術力量雄厚，醫(yī)療設備先進，是集醫(yī)療、教學、科研為一體的江蘇省正規(guī)甲等醫(yī)院。醫(yī)院地處市中心鼓樓區(qū)，交通地理優(yōu)越，占地面積3.9萬平方米，擁有現(xiàn)代化的20層門診病房大樓、醫(yī)技病房大樓、急診樓、120急救分站、地下停車場等，現(xiàn)有床位1420張。醫(yī)院是江蘇省傳染科質量控制中心、傳染科診療技術中心、江蘇省診療中心、江蘇省中西醫(yī)結合肝病研究中心，江蘇省緊急醫(yī)學救援基地，南京中醫(yī)藥大學溫病研究所臨床基地。有臨床核心?？?個，省市核心學科、專科10個，中醫(yī)藥管理局核心研究室1個。其中感染病科為臨床核心?？啤魅静W為江蘇省醫(yī)學核心學科，傳染內(nèi)科為江蘇省核心專科，中西醫(yī)結合科為江蘇省綜合（專科）醫(yī)院示范中醫(yī)科建設單位，肝內(nèi)科、肝病檢測實驗中心、婦產(chǎn)科、外科、感染病科、中西醫(yī)結合科為南京市核心專科，中心實驗室為南京市醫(yī)學核心實驗室建設單位。2013年6月新醫(yī)技病房樓落成并投入使用，江蘇省衛(wèi)生廳與市批準同意，南京市第二醫(yī)院與開展全面業(yè)務技術合作，南京市第二醫(yī)院加入江蘇省人民醫(yī)院集團，江蘇省人民醫(yī)院在二院建立院區(qū)（即：江蘇省人民醫(yī)院南京二院院區(qū)），共計10個病區(qū)，450張病床，以加強綜合學科建設，提高傳染病危重病人的綜合救治能力。醫(yī)院現(xiàn)有在職職工1070人，衛(wèi)技人員占82.3%，專業(yè)職稱人員142人，博士17人，碩士研究生196人?，F(xiàn)任院長趙偉博士是東南大學博士生導師，江蘇省醫(yī)學領軍人才，江蘇省傳染病學科帶頭人，江蘇省院長，江蘇省表彰的省有突出貢獻中青年醫(yī)生，表彰的衛(wèi)生系統(tǒng)先進個人，醫(yī)師獎、中西醫(yī)結合貢獻獎獲得者，享受國務院特殊津貼。醫(yī)院設有42個臨床醫(yī)技科室，包括普內(nèi)科、肝病內(nèi)科、消化科、感染病科、中西醫(yī)結合科、腫瘤內(nèi)科、老年病科、普外科、肝膽外科、胃腸外科、甲乳外科、泌尿外科、腫瘤外科、骨科、心血管內(nèi)科、整形科、婦科、產(chǎn)科、婦瘤科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、重癥醫(yī)學科、人工肝治療中心、血液透析及腎內(nèi)科、血液內(nèi)科、皮膚科、體檢中心、放射科、超聲診斷科、介入放射科、放療科、檢驗科、藥學部、臨床科研中心等臨床醫(yī)技科室。門診設有相應的專科及醫(yī)生特色門診。醫(yī)院擁有核磁共振（MRI）、64排、16排螺旋CT、直線加速器、1000MA大型DSA、血液透析機、人工肝支持系統(tǒng)、數(shù)字胃腸X光機、C臂X光機等先進儀器設備，為醫(yī)院的醫(yī)療及科研工作的開展提供了保證，使醫(yī)院各種檢查及檢測項目準確性和率都處于全省率先水平。近五年醫(yī)院共取得科研成果77項，其中部級獎5項，省級15項。承擔國際合作項目2項，核心專項6項，自然科學基金8項，省部級項目16項。編寫專著7部，獲專利證7項。發(fā)表SCI論文74篇（較高影響因子39.06），中華系列期刊論文127篇。該院兩次榮獲衛(wèi)生系統(tǒng)先進集體、連續(xù)多年保持江蘇省文明單位、南京市文明單位稱號。