，又名南京學院附屬鼓樓醫(yī)院，是一所集醫(yī)療、教學、科研為一體的綜合性大型正規(guī)甲等醫(yī)院。前身是1892年由美國基督會資助的加拿大籍傳教士威廉·愛德華·麥克林醫(yī)學博士（WilliamE.Macklin，中文譯音"馬林"）創(chuàng)建的一所"基督醫(yī)院"，馬林任首任院長，民間又稱"馬林醫(yī)院"。鼓樓醫(yī)院由建院時50張病床，百余名員工，發(fā)展到現(xiàn)在已擁有核定床位2500張，在崗職工3863名，其中：衛(wèi)生專業(yè)技術人員3398人，正、副主任醫(yī)師400余人，正、副教授220余人，博士生導師40余人、碩士生導師180余，40位醫(yī)生享受國務院特殊津貼。2014年醫(yī)院門急診病人290余萬人次，出院病人8.2萬余例。鼓樓醫(yī)院科室設置齊全，技術力量雄厚。外科學是核心學科共建單位，骨科、產科、消化科、內分泌科、普通外科、風濕免疫科、科和護理專業(yè)是臨床核心?？疲文懲饪?、骨科是江蘇省臨床醫(yī)學中心，產科學、風濕免疫病學、腫瘤內科學、心胸外科學、代謝病學、學為江蘇省"科技興衛(wèi)工程"核心學科。矯治、肝移植、異基因間充質干移植、生殖醫(yī)學、親體腎移植、消化系統(tǒng)疾病的內鏡診斷和介入技術、三維適形調強放療等技術處于國際或國內率先水平。普外科、婦產科、骨科、呼吸內科、免疫科、麻痹科、泌尿外科、肝膽外科、消化內科、內分泌科、血液科、心胸外科、心血管內科、腫瘤科、整形科、醫(yī)學檢驗科、神經內科、急診醫(yī)學科、重癥醫(yī)學科、神經外科、耳鼻咽喉科、藥學部、病理科、醫(yī)學影像科為江蘇省臨床核心?？疲芡饪?、感染科、腎內科、老年醫(yī)學科、科、疼痛科、中醫(yī)科為南京市醫(yī)學核心?？?。2006年醫(yī)院被人事部批準設立"博士后科研流動工作站"，目前醫(yī)院有一級臨床醫(yī)學博士學位授予點2個，二級學科博士學位授予點16個，碩士學位授予點25個，醫(yī)院被批準為專科醫(yī)師、臨床藥師和心血管介入診療技術（介入）培訓基地。江蘇省醫(yī)院感染管理、骨科、婦產科、泌尿外科、消化科5個醫(yī)療質量控制中心及江蘇省腦血管疾病、圍產期疾病、消化內鏡、骨關節(jié)疾病、大血管疾病、代謝性疾病和風濕免疫性疾病8個江蘇省省級專科（?。┰\療中心均落戶在鼓樓醫(yī)院。醫(yī)院是開展臨床路徑、專業(yè)護理服務示范工程核心聯(lián)系單位之一。鼓樓醫(yī)院擁有一大批國際先進的醫(yī)療設備，是江蘇省獲得達芬奇手術機器人和TOMO系統(tǒng)兩項甲類配置證的地方醫(yī)院，其他先進設備還包括：PET-CT、ECT、ELEKTA雙光子直線加速器和寶石能譜CT、1.5T和3.0T磁共振、超聲內鏡系統(tǒng)、重癥監(jiān)護系統(tǒng)、PACS影像存儲系統(tǒng)、全自動發(fā)藥系統(tǒng)和符合國際標準的百級凈化手術室等。2004年，南京市委市決定向南擴建鼓樓醫(yī)院，并將其作為南京市發(fā)展社會公共事業(yè)的核心項目和民生工程，這是一座集門診、急診、住院病房和醫(yī)技檢查功能為一體、建筑面積22.4萬平方米，充分體現(xiàn)"以人為本"理念，彰顯文化、環(huán)保、生態(tài)、節(jié)能等元素的超大型智能化、現(xiàn)代化醫(yī)療綜合大樓。工程于2007年7月全面動工，2009年7月4日大樓結構封頂，2012年12月15日正式投入使用，日門診量可容納1.5萬人次，病床達到3000張。該大樓獲世界建筑資訊獎和國內建筑行業(yè)工程質量較高獎——魯班獎。近些年來，鼓樓醫(yī)院在傳承百年歷史文化的同時，實施科學管理、打造醫(yī)院文化品牌，建成了國內以實物為主的個醫(yī)院歷史紀念館，該館被定為"南京市愛國主義教育基地"、"南京市對外文化交流基地"。醫(yī)院不斷改進創(chuàng)新，組建了國內個醫(yī)院集團。在國內率先提出人文醫(yī)院構想，探索了具有鼓樓醫(yī)院特色的人文醫(yī)院管理模式，評價體系和營、尊重人、滿足人、發(fā)展人的人文環(huán)境。近年來，為適應醫(yī)改新形勢、新要求，落實精細化，推動人文落地，實施目標管理、資源配置、質量控制、成本核算、績效激勵、支撐保障等六大工程。醫(yī)院被中央文明委表彰為"創(chuàng)建文明行業(yè)工作先進集體"、文明單位"；被授予"衛(wèi)生系統(tǒng)先進單位"、"醫(yī)院文化工作先進單位"、"2005-2007醫(yī)院管理年活動先進單位"、"醫(yī)院改進創(chuàng)新獎"等稱號。