主要用于肛瘺的急性炎癥，可根據(jù)分泌物的情況或通過藥敏試驗(yàn)，選擇不同的抗生素。中藥以清熱解毒為主，佐以祛濕的藥物，如連翹、蒲公英、黃芩、黃連、黃柏、梔子、金銀花、澤瀉、木通等。
另外可外用抗生素軟離、或金黃膏、四黃膏同部外涂，或坐浴對控制炎癥均有好處。