世界上沒有兩片完全相同的葉子，也沒有兩個(gè)完全一樣的腫瘤!

幾年前，腫瘤的治療還停留在根據(jù)癌癥分類例如：肺癌，乳腺癌，肝癌，胃癌，結(jié)腸癌，直腸癌等進(jìn)行治療，大多數(shù)患者雖然都有特別的腫瘤類型，但是他們大都被施以相同的化療方案。

隨著“精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)”時(shí)代的到來，迅速發(fā)展到了“量體裁衣”的個(gè)體化治療，而基因檢測，是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的核心部分。在歐美及日本癌癥的診斷及治療已經(jīng)進(jìn)入全面的基因時(shí)代。一位患者患了癌癥，不僅要做病理診斷還要做全基因檢測，發(fā)現(xiàn)突變位點(diǎn)，進(jìn)而為患者制定治療方案包括化療、突變點(diǎn)生物肽的制定及選擇，以及家族癌癥風(fēng)險(xiǎn)評估。

什么是癌癥基因?

癌細(xì)胞與正常細(xì)胞，有很多不同;其中，最重要的不同就是癌細(xì)胞中不少基因是變異的：有的基因缺失了，有的基因重復(fù)了，有的基因長歪了……

癌癥中可能發(fā)生許多類型的基因改變。四種主要類型包括：

1) 單核苷酸變異體(SNV)，也稱為點(diǎn)突變。SNV由一個(gè)堿基處的堿基置換產(chǎn)生。這些可能導(dǎo)致編碼蛋白的氨基酸序列(錯(cuò)義突變)或蛋白過早截短(無義突變)。

2) 連續(xù)核苷酸的小復(fù)制，涉及一個(gè)或幾個(gè)核苷酸的插入或缺失，或涉及同時(shí)缺失和插入一個(gè)或幾個(gè)堿基(indelsa)的復(fù)雜突變。這些類型的突變可能是“框內(nèi)的”，導(dǎo)致蛋白質(zhì)中氨基酸的加入或減少，或可導(dǎo)致“移碼”，通常導(dǎo)致蛋白質(zhì)的過早截短。

3) 外顯子或基因拷貝數(shù)目的變化。外顯子拷貝數(shù)變化包括包含整個(gè)外顯子并影響蛋白質(zhì)功能結(jié)構(gòu)域的大的重復(fù)或缺失?；? 拷貝數(shù)變化包括整個(gè)基因的擴(kuò)增或缺失。

4) 遺傳物質(zhì)的結(jié)構(gòu)變異(SV)或大的結(jié)構(gòu)異常，包括由多個(gè)染色體之間或單個(gè)染色體內(nèi)的斷點(diǎn)引起的易位或倒位。這些通常導(dǎo)致融合基因和相關(guān)融合蛋白。

通常，致癌突變聚集在來自不同患者的腫瘤的“熱點(diǎn)”突變。一些熱點(diǎn)SNV可能會(huì)頻繁發(fā)生，而另一些則很少見。例如，在所有黑素瘤中，40%發(fā)生BRAF V600E 突變，而BRAF L597S 突變的發(fā)生<1%。

什么是癌癥基因檢測?

我們都知道，癌癥是一種具有遺傳傾向的疾病，跟基因突變有著千絲萬縷的聯(lián)系，而這些基因在某些程度上，也決定了癌細(xì)胞的生長與分裂，并且這種突變也可能會(huì)遺傳。這時(shí)候就可以針對腫瘤的基因圖譜進(jìn)行測試，從而確定到底是發(fā)生了哪些突變，而這個(gè)過程就叫做基因檢測。

在實(shí)際的治療過程中，基因檢測可以幫助醫(yī)生制定最佳的治療方案。比如：一些人患肺癌后，可以利用基因檢測的手段對癌細(xì)胞中的EGFR進(jìn)行檢測，一旦發(fā)現(xiàn)了該突變，就可以利用對應(yīng)的靶向藥進(jìn)行治療。再比如，有一些非常難以確診的腫瘤，需要依靠特定的基因改變協(xié)助確診。比如，不少肉瘤都長的像梭子一樣，長長扁扁的，這時(shí)候如果基因檢測發(fā)現(xiàn)有ASPL-TFE3融合基因，那診斷腺泡軟組織肉瘤，就八九不離十了。

利用各種方法，把這些變異的基因找出來，仔細(xì)分析，可以協(xié)助臨床診斷、指導(dǎo)治療選擇、輔助監(jiān)測疾病復(fù)發(fā)和耐藥、預(yù)估生存期等。

腫瘤基因測試范圍從簡單到復(fù)雜。最簡單的測試只檢測一種基因中的一種類型的突變。比如僅在BRAF位置c.1799處尋找特定T到A置換突變的試驗(yàn)。

相反，最復(fù)雜的測試可以同時(shí)檢測所有主要類型的基因改變，包括替換，重復(fù)，插入，缺失，插入，基因拷貝數(shù) 變異和結(jié)構(gòu)變體，包括倒位和易位。

癌癥基因檢測的技術(shù)

等位基因特異性PCR

優(yōu)點(diǎn)：敏感性 - 需要突變存在1-5%。無需特殊設(shè)備。

缺點(diǎn)：目標(biāo)特異性，無法檢測到可能存在于腫瘤DNA中的其他突變。

Sanger雙脫氧測序

優(yōu)點(diǎn)：可以檢測到各種未知的突變。如果首次從樣本中提取融合轉(zhuǎn)錄物的RNA，可用于檢測基因融合。無需特殊設(shè)備。

缺點(diǎn)：勞動(dòng)強(qiáng)度大，需要突變DNA存在20-25%。無法檢測到外顯子或基因 拷貝數(shù)的變化。

焦磷酸測序

優(yōu)點(diǎn)：快速和靈敏地檢測5%水平的突變DNA。

缺點(diǎn)：需要焦磷酸測序儀器; 在可以在腫瘤DNA中檢測到的突變類型方面受到限制。

質(zhì)譜法

優(yōu)點(diǎn)：靈敏，存在5-10%可靠地檢測突變DNA; 測試多個(gè)基因。

缺點(diǎn)：需要質(zhì)譜儀器; SNV特異性并且不能檢測可能存在的腫瘤DNA中的其他突變。

單堿基擴(kuò)展測定

優(yōu)點(diǎn)：靈敏，可靠地檢測突變DNA，如果以5-10%存在; 測試多個(gè)基因。無需特殊設(shè)備。

缺點(diǎn)： SNV特異性并且不能檢測可能存在于腫瘤DNA中的其他突變。

多重連接依賴性探針擴(kuò)增 - MLPA

優(yōu)點(diǎn)：快速且能夠同時(shí)檢測多個(gè)突變。無需特殊設(shè)備?？梢詸z測到10%的目標(biāo)SNV。

缺點(diǎn)：對于外顯子或基因 拷貝數(shù)變異檢測，需要突變DNA以20-40%的水平存在。靶向的SNV和外顯子和基因 拷貝數(shù)變體都是特異性的，并且不能檢測到腫瘤DNA中的其他突變。試劑盒可能不適用于感興趣的基因或突變。新鮮冰凍組織檢測效果優(yōu)于石蠟包埋組織提取DNA。

熒光原位雜交 - FISH

優(yōu)點(diǎn)：輕松檢測基因 拷貝數(shù)變化和有針對性的SV，這些SV不易被其他方法檢測到; 基于細(xì)胞的成像可以檢測一小部分細(xì)胞中的事件。

缺點(diǎn)：需要石蠟包埋組織未染色的切片; 無法檢測到實(shí)體瘤腫瘤中發(fā)生的大多數(shù)突變類型。

新一代測序-擴(kuò)增捕獲

優(yōu)點(diǎn)：能夠同時(shí)檢測單個(gè)堿基替換以及更復(fù)雜的突變，包括單次測定中許多基因中的重復(fù)，插入，缺失和插入缺失; 需要少量的DNA。當(dāng)測序到高“覆蓋深度”(1000x覆蓋率)時(shí)，測定對于檢測低豐度突變是敏感的。

缺點(diǎn)：昂貴; 需要一種完全不同于其他分子檢測方法的DNA制備方法。無法檢測基因 拷貝數(shù)變化和SV。

新一代測序 - 雜交捕獲

優(yōu)點(diǎn)：能夠同時(shí)檢測單個(gè)測定中許多基因中的替換，重復(fù)，插入，缺失，插入和外顯子和基因 拷貝數(shù)變化。探針也可以設(shè)計(jì)為捕獲經(jīng)常重新排列的基因中的選擇性易位斷點(diǎn)，如FoundationOne TM。

缺點(diǎn)：昂貴; 需要與傳統(tǒng)上用于其他分子突變測定的完全不同的DNA制備方法; 需要更多的腫瘤組織; 需要復(fù)雜的生物信息學(xué)。

新一代測序 - 全外顯子組測序

優(yōu)點(diǎn)：綜合性中等。在同一檢測中，可同時(shí)檢測許多基因中的替換，重復(fù)，插入，缺失，插入和外顯子和基因 拷貝數(shù)變化。

缺點(diǎn)：昂貴; 需要完全不同于傳統(tǒng)上用于其他分子突變檢測技術(shù)的DNA制備方法; 需要更多的腫瘤組織; 需要復(fù)雜的生物信息學(xué)。

新一代測序 - 全基因組測序

優(yōu)點(diǎn)：最全面?？赏瑫r(shí)檢測整個(gè)基因組中的替換，重復(fù)，插入，缺失，插入，基因和外顯子拷貝數(shù)變化以及染色體反轉(zhuǎn)和易位。

缺點(diǎn)：昂貴和低產(chǎn)量; 需要完全不同于傳統(tǒng)上用于大多數(shù)突變檢測技術(shù)的DNA制備方法; 需要更多的腫瘤組織; 需要復(fù)雜的生物信息學(xué); 對數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和處理有巨大的計(jì)算需求。

數(shù)字PCR - ddPCR

優(yōu)點(diǎn)：高水平的敏感性和特異性; 相對便宜。

缺點(diǎn)：只能檢測已知的有針對性的突變 ; 受限于檢測到的突變類型; 每個(gè)測定只能檢測到有限數(shù)量的突變。

BEAMing技術(shù)

優(yōu)點(diǎn)：高度的敏感性和特異性

缺點(diǎn)：只能檢測已知的有針對性的突變 ; 受限于檢測到的突變類型; 每個(gè)測定只能檢測到有限數(shù)量的突變。

什么是基于基因檢測的靶向治療?

在惡性腫瘤的治療中，一個(gè)令人困惑的問題就是：同一分期、同一病理類型的惡性腫瘤患者，采用相同的治療方案，其療效(如生存期)為什么會(huì)存在明顯差異?

隨著人類基因組計(jì)劃的完成，研究人員發(fā)現(xiàn)同一類型腫瘤的細(xì)胞分子生物學(xué)差異可能是導(dǎo)致疾病個(gè)體化差異的原因所在，繼而發(fā)現(xiàn)了一些與腫瘤發(fā)生密切相關(guān)的基因，即腫瘤的“驅(qū)動(dòng)基因”。肺癌已知的驅(qū)動(dòng)基因包括EGFR、ALK、KRAS、HER2、BRAF、PIK3CA、AKTI、MEKI、NRAS和MET。驅(qū)動(dòng)基因不同，患者對腫瘤的治療反應(yīng)也就不同，這就是相同分型、分期的腫瘤患者存在療效差異的原因。

目前一些藥物如靶向藥物具有特異性針對某種腫瘤基因突變達(dá)到精準(zhǔn)殺傷的效果，而不同腫瘤患者腫瘤驅(qū)動(dòng)基因突變存在差異，因此通過基因檢測，了解患者哪種基因發(fā)生突變，適合應(yīng)用哪種藥物，也就達(dá)到了“量體裁衣”的效果，做到了“精準(zhǔn)醫(yī)療”。

比如，晚期肺腺癌病友，超過一半都攜帶EGFR、ALK、ROS-1等基因突變，這類病人就有機(jī)會(huì)嘗試靶向藥了，有效率高、副作用小、生存期相對較長。甚至有一些患者依靠一代一代的靶向藥聯(lián)合傳統(tǒng)放化療，生存期超過10年、20年的超級幸運(yùn)案例。

基因檢測的方案有哪些?

看了上面的介紹，是不是感受到了基因檢測的極端復(fù)雜性——的確是這樣的，每個(gè)病人到底應(yīng)該做哪些基因的檢測，才能做到盡可能不遺漏(不錯(cuò)過治療機(jī)會(huì)，不浪費(fèi)標(biāo)本)、又不多花冤枉錢，這里面學(xué)問很大很大……

對患者來說，真正關(guān)鍵的問題是檢測什么基因，目前醫(yī)院和各大基因檢測公司都有針對不同人群的各類套餐，總結(jié)如下：

1、單癌種小penel檢測：比如，對于肺癌患者，已知的驅(qū)動(dòng)基因包括EGFR、ALK、KRAS、HER2、BRAF、PIK3CA、AKTI、MEKI、NRAS和MET，那么只檢測這些常見突變的基因就可以了。目前國內(nèi)權(quán)威的基因檢測公司如泛生子、世和都推出了針對不同癌種的檢測項(xiàng)目，如肺癌18基因、腦瘤63基因檢測等。

優(yōu)勢：價(jià)格便宜。拿肺癌舉例，由于中國肺腺癌中超過一半的患者是攜帶EGFR和ALK兩個(gè)突變之一，這種方案性價(jià)比較高。所以，如果患者屬于肺腺癌，而且經(jīng)濟(jì)條件一般，把有限的錢用在刀刃上才是更合理的。

2、全基因檢測：同時(shí)檢測幾十個(gè)甚至上百個(gè)癌癥相關(guān)基因，比如，F(xiàn)DA批準(zhǔn)的首款獲得突破性認(rèn)定的癌癥NGS體外診斷檢測產(chǎn)品--FoundationOne CDx (F1CDx)可檢測324個(gè)基因的突變，還可以檢測TMB和MSI兩個(gè)基因組特征。

優(yōu)勢：使用新一代測序技術(shù)，最大優(yōu)勢是覆蓋面大，一次就能綜合了解情況，但它目前比第一種方案昂貴。當(dāng)然，隨著新測序技術(shù)越來越便宜，最終第一個(gè)方案肯定會(huì)被取代，但目前，還是二者共存。

3、多平臺(tái)分子分析：傳統(tǒng)基因檢測實(shí)際受益的患者不到10%!美國凱瑞思精準(zhǔn)生命科學(xué)公司是全球領(lǐng)先的分子科學(xué)創(chuàng)新者，不單單提供靶向治療選擇，而是通過全基因檢測+ 多平臺(tái)分子檢測服務(wù)，同時(shí)從DNA、RNA和蛋白質(zhì)三大層面(一般的二代測序僅基于DNA)，揭示每位癌癥患者的分子藍(lán)圖，全面分析用藥方案，精準(zhǔn)的為臨床醫(yī)生及患者呈現(xiàn)化療、靶向治療及免疫治療藥物在內(nèi)的所有治療選擇!

優(yōu)勢：是目前最全面的精準(zhǔn)檢測項(xiàng)目，幫助臨床醫(yī)生和患者找到所有潛在的臨床有效藥物，避免采用無效的藥物。

全球腫瘤醫(yī)生網(wǎng)提醒大家，每個(gè)病人，其實(shí)都要綜合腫瘤的種類、疾病的分期、之前治療的情況、后續(xù)治療的愿望、以及家庭經(jīng)濟(jì)承受能力，做一個(gè)“個(gè)性化”的安排，歡迎大家來咨詢?nèi)蚰[瘤醫(yī)生網(wǎng)醫(yī)學(xué)部的相關(guān)專家。

基因檢測用什么樣品做?

做基因檢測，是檢測腫瘤細(xì)胞的突變，因此需要獲取腫瘤細(xì)胞。

臨床上通常有三種方式：

1. 肺癌手術(shù)中(或胸水中)得到腫瘤樣品。

2. 穿刺活檢樣品，通常是在局部麻醉下，使用很細(xì)的針刺入疑似腫瘤，來獲取少量細(xì)胞用于分析。這樣創(chuàng)傷很小，可以避免不必要的手術(shù)，對患者影響小。

3. “液體活檢”。肺癌的液體活檢，主要是指通過分析血液里的癌細(xì)胞或者癌細(xì)胞釋放的DNA進(jìn)行分析，判斷癌癥突變類型。這之所以能成功，是因?yàn)橥砥诎┘?xì)胞，或者癌細(xì)胞的DNA，會(huì)經(jīng)常跑到血液里面，現(xiàn)代技術(shù)有可能把它們捕獲，進(jìn)行分析。

“液體活檢”是目前最熱門的技術(shù)之一，最大的優(yōu)點(diǎn)是無創(chuàng)，風(fēng)險(xiǎn)小，而且可以反復(fù)多次取樣，但目前依然以組織病理切片的基因檢測，準(zhǔn)確度最高，是業(yè)內(nèi)公認(rèn)的金標(biāo)準(zhǔn)。雖然它也不是100%完美(比如還有空間、時(shí)間、異質(zhì)性的問題)。但是，常常能遇到病友無法取得足夠的組織，或者組織標(biāo)本年代久遠(yuǎn)，這類情況下，也可以考慮用血液標(biāo)本勉強(qiáng)代替。我們一般推薦的優(yōu)劣順序是：最近手術(shù)或活檢新取的組織標(biāo)本>1-2年內(nèi)的組織標(biāo)本>最新的血標(biāo)本>2年以上的舊的組織標(biāo)本。

癌癥患者一定要做基因檢測嗎?

廣義上講，所有腫瘤患者均可以接受基因檢測;狹義上講，根據(jù)指南推薦，不同的病種、不同的分期、出于不同的目的，不同的患者，適合做不同的基因檢測。

比如，一個(gè)晚期肺腺癌患者，尚未接受任何治療，家庭經(jīng)濟(jì)情況一般，只是為了看看，是否有合適的已經(jīng)在內(nèi)地上市的靶向藥可用，那么只要測一下最常見的那幾個(gè)基因就可以了。

比如，一個(gè)超級土豪，是一個(gè)肉瘤，其他藥物治療都失敗了，但是依然想碰碰運(yùn)氣，看看是不是自己還有靶向藥可用：不管是已經(jīng)上市還是處于臨床試驗(yàn)研究階段的，不管是國內(nèi)還是國外，都想知道。那么，他或許可以選擇做一下跨癌種的、盡可能多的、幾十上百甚至全部的基因。

但是，在癌癥的治療過程當(dāng)中，有一部分人在接受靶向治療前，選擇不做基因檢測，而這種治療方法就叫做盲試。對比基因檢測，盲試也有自己的優(yōu)勢，比如即能省錢又能節(jié)省時(shí)間。那么到底什么情況才可以跳過基因檢測，直接進(jìn)行靶向治療呢?

1、靶向藥單一：一些種類的癌癥，可能突變類型比較單一，對于靶向藥也沒有可選余地，這種情況下，可以選擇盲試，一旦發(fā)現(xiàn)沒有效果，就需要更他療法。

2、生存期不樂觀：對于一些癌癥友友，可能醫(yī)生的預(yù)估不足6個(gè)月，并且經(jīng)濟(jì)條件也不好，這種情況，如果拿半個(gè)月等一個(gè)不確定的結(jié)果的話，就顯得太冒險(xiǎn)，所以不如直接進(jìn)行盲試，把錢用在刀刃上，挑選概率最大的進(jìn)行嘗試，俗稱“闖大運(yùn)”。

當(dāng)然盲試也有著自己的短板，在沒有基因檢測之前，用藥基本靠“猜”，而效果也基本靠“祈禱”，所以在治療的過程中，對于是否進(jìn)行靶向治療，大家可以在咨詢主治醫(yī)生或腫瘤患者權(quán)威的服務(wù)平臺(tái)全球腫瘤醫(yī)生網(wǎng)后慎重決定。下面我們還會(huì)介紹國內(nèi)外權(quán)威的基因檢測公司排名，目前獲批的靶向藥物列表等癌癥患者關(guān)心的問題，感興趣的患者可以關(guān)注微信號第一時(shí)間獲得最新消息。